Search everything

Research output

Search results

  • A phase II study of palbociclib plus letrozole plus trastuzumab as neoadjuvant treatment for clinical stages II and III ER+ HER2+ breast cancer (PALTAN)

    Ademuyiwa, F. O., Northfelt, D. W., O’Connor, T., Levine, E., Luo, J., Tao, Y., Hoog, J., Laury, M. L., Summa, T., Hammerschmidt, T., Guo, Z., Frith, A., Weilbaecher, K., Opyrchal, M., Aft, R., Clifton, K., Suresh, R., Bagegni, N., Hagemann, I. S. & Iglesia, M. D. & 1 others, Ma, C. X., Dec 2023, In: npj Breast Cancer. 9, 1, 1.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

    Open Access
    5 Scopus citations
  • Functional Annotation of ESR1 Gene Fusions in Estrogen Receptor-Positive Breast Cancer

    Lei, J. T., Shao, J., Zhang, J., Iglesia, M., Chan, D. W., Cao, J., Anurag, M., Singh, P., He, X., Kosaka, Y., Matsunuma, R., Crowder, R., Hoog, J., Phommaly, C., Goncalves, R., Ramalho, S., Peres, R. M. R., Punturi, N., Schmidt, C. & Bartram, A. & 23 others, Jou, E., Devarakonda, V., Holloway, K. R., Lai, W. V., Hampton, O., Rogers, A., Tobias, E., Parikh, P. A., Davies, S. R., Li, S., Ma, C. X., Suman, V. J., Hunt, K. K., Watson, M. A., Hoadley, K. A., Thompson, E. A., Chen, X., Kavuri, S. M., Creighton, C. J., Maher, C. A., Perou, C. M., Haricharan, S. & Ellis, M. J., Aug 7 2018, In: Cell Reports. 24, 6, p. 1434-1444.e7

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

    Open Access
    83 Scopus citations
  • Spatially restricted drivers and transitional cell populations cooperate with the microenvironment in untreated and chemo-resistant pancreatic cancer

    Cui Zhou, D., Jayasinghe, R. G., Chen, S., Herndon, J. M., Iglesia, M. D., Navale, P., Wendl, M. C., Caravan, W., Sato, K., Storrs, E., Mo, C. K., Liu, J., Southard-Smith, A. N., Wu, Y., Naser Al Deen, N., Baer, J. M., Fulton, R. S., Wyczalkowski, M. A., Liu, R. & Fronick, C. C. & 46 others, Fulton, L. A., Shinkle, A., Thammavong, L., Zhu, H., Sun, H., Wang, L. B., Li, Y., Zuo, C., McMichael, J. F., Davies, S. R., Appelbaum, E. L., Robbins, K. J., Chasnoff, S. E., Yang, X., Reeb, A. N., Oh, C., Serasanambati, M., Lal, P., Varghese, R., Mashl, J. R., Ponce, J., Terekhanova, N. V., Yao, L., Wang, F., Chen, L., Schnaubelt, M., Lu, R. J. H., Schwarz, J. K., Puram, S. V., Kim, A. H., Song, S. K., Shoghi, K. I., Lau, K. S., Ju, T., Chen, K., Chatterjee, D., Hawkins, W. G., Zhang, H., Achilefu, S., Chheda, M. G., Oh, S. T., Gillanders, W. E., Chen, F., DeNardo, D. G., Fields, R. C. & Ding, L., Sep 2022, In: Nature Genetics. 54, 9, p. 1390-1405 16 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

    Open Access
    114 Scopus citations
  • MITI minimum information guidelines for highly multiplexed tissue images

    Human Tumor Atlas Network, Ademuyiwa, F. O., Aft, R., Bayguinov, P., Cao, S., Caravan, W., Chasnoff, S., Chatterjee, D., Chen, F., Chen, S., Chheda, M. G., Colditz, G. A., Zhou, D. C., Davies, S. R., Denardo, D., Ding, L., DiPersio, J., Eberlein, T. J., Fields, R. C. & Fitzpatrick, J. & 28 others, Fulton, B., Gillanders, W. E., Hawkins, W. G., Hsieh, J. J., Iglesia, M. D., Jayasinghe, R. G., Ju, T., Kim, A. H., Krishnamoorthy, P., Li, Y., Liang, W. W., Lim, K. H., Liu, R., Ma, C., Maher, C., Mashl, J., McMichael, J., Mudd, J., Deen, N. N. A., Oh, S. T., Patti, G. J., Puram, S. V., Shoghi, K. I., Song, S. K., Veis, D. J., Wahl, R., Wendl, M. C. & Wyczalkowski, M. A., Mar 2022, In: Nature Methods. 19, 3, p. 262-267 6 p.

    Research output: Contribution to journalComment/debate

    Open Access
    34 Scopus citations
  • Comprehensive molecular portraits of human breast tumours

    Koboldt, D. C., Fulton, R. S., McLellan, M. D., Schmidt, H., Kalicki-Veizer, J., McMichael, J. F., Fulton, L. L., Dooling, D. J., Ding, L., Mardis, E. R., Wilson, R. K., Ally, A., Balasundaram, M., Butterfield, Y. S. N., Carlsen, R., Carter, C., Chu, A., Chuah, E., Chun, H. J. E. & Coope, R. J. N. & 323 others, Dhalla, N., Guin, R., Hirst, C., Hirst, M., Holt, R. A., Lee, D., Li, H. I., Mayo, M., Moore, R. A., Mungall, A. J., Pleasance, E., Robertson, A. G., Schein, J. E., Shafiei, A., Sipahimalani, P., Slobodan, J. R., Stoll, D., Tam, A., Thiessen, N., Varhol, R. J., Wye, N., Zeng, T., Zhao, Y., Birol, I., Jones, S. J. M., Marra, M. A., Cherniack, A. D., Saksena, G., Onofrio, R. C., Pho, N. H., Carter, S. L., Schumacher, S. E., Tabak, B., Hernandez, B., Gentry, J., Nguyen, H., Crenshaw, A., Ardlie, K., Beroukhim, R., Winckler, W., Getz, G., Gabriel, S. B., Meyerson, M., Chin, L., Kucherlapati, R., Hoadley, K. A., Auman, J. T., Fan, C., Turman, Y. J., Shi, Y., Li, L., Topal, M. D., He, X., Chao, H. H., Prat, A., Silva, G. O., Iglesia, M. D., Zhao, W., Usary, J., Berg, J. S., Adams, M., Booker, J., Wu, J., Gulabani, A., Bodenheimer, T., Hoyle, A. P., Simons, J. V., Soloway, M. G., Mose, L. E., Jefferys, S. R., Balu, S., Parker, J. S., Hayes, D. N., Perou, C. M., Malik, S., Mahurkar, S., Shen, H., Weisenberger, D. J., Triche, T., Lai, P. H., Bootwalla, M. S., Maglinte, D. T., Berman, B. P., Van Den Berg, D. J., Baylin, S. B., Laird, P. W., Creighton, C. J., Donehower, L. A., Noble, M., Voet, D., Gehlenborg, N., Di Cara, D., Zhang, J., Zhang, H., Wu, C. J., Yingchun Liu, S., Lawrence, M. S., Zou, L., Sivachenko, A., Lin, P., Stojanov, P., Jing, R., Cho, J., Sinha, R., Park, R. W., Nazaire, M. D., Robinson, J., Thorvaldsdottir, H., Mesirov, J., Park, P. J., Reynolds, S., Kreisberg, R. B., Bernard, B., Bressler, R., Erkkila, T., Lin, J., Thorsson, V., Zhang, W., Shmulevich, I., Ciriello, G., Weinhold, N., Schultz, N., Gao, J., Cerami, E., Gross, B., Jacobsen, A., Sinha, R., Aksoy, B. A., Antipin, Y., Reva, B., Shen, R., Taylor, B. S., Ladanyi, M., Sander, C., Anur, P., Spellman, P. T., Lu, Y., Liu, W., Verhaak, R. R. G., Mills, G. B., Akbani, R., Zhang, N., Broom, B. M., Casasent, T. D., Wakefield, C., Unruh, A. K., Baggerly, K., Coombes, K., Weinstein, J. N., Haussler, D., Benz, C. C., Stuart, J. M., Benz, S. C., Zhu, J., Szeto, C. C., Scott, G. K., Yau, C., Paull, E. O., Carlin, D., Wong, C., Sokolov, A., Thusberg, J., Mooney, S., Ng, S., Goldstein, T. C., Ellrott, K., Grifford, M., Wilks, C., Ma, S., Craft, B., Yan, C., Hu, Y., Meerzaman, D., Gastier-Foster, J. M., Bowen, J., Ramirez, N. C., Black, A. D., Pyatt, R. E., White, P., Zmuda, E. J., Frick, J., Lichtenberg, T. M., Brookens, R., George, M. M., Gerken, M. A., Harper, H. A., Leraas, K. M., Wise, L. J., Tabler, T. R., McAllister, C., Barr, T., Hart-Kothari, M., Tarvin, K., Saller, C., Sandusky, G., Mitchell, C., Iacocca, M. V., Brown, J., Rabeno, B., Czerwinski, C., Petrelli, N., Dolzhansky, O., Abramov, M., Voronina, O., Potapova, O., Marks, J. R., Suchorska, W. M., Murawa, D., Kycler, W., Ibbs, M., Korski, K., Spychała, A., Murawa, P., Brzeziński, J. J., Perz, H., Łaźniak, R., Teresiak, M., Tatka, H., Leporowska, E., Bogusz-Czerniewicz, M., Malicki, J., Mackiewicz, A., Wiznerowicz, M., Van Le, X., Kohl, B., Viet Tien, N., Thorp, R., Van Bang, N., Sussman, H., Phu, B. D., Hajek, R., Hung, N. P., Phuong, T. V. T., Thang, H. Q., Khan, K. Z., Penny, R., Mallery, D., Curley, E., Shelton, C., Yena, P., Ingle, J. N., Couch, F. J., Lingle, W. L., King, T. A., Gonzalez-Angulo, A. M., Dyer, M. D., Liu, S., Meng, X., Patangan, M., Waldman, F., Stöppler, H., Rathmell, W. K., Thorne, L., Huang, M., Boice, L., Hill, A., Morrison, C., Gaudioso, C., Bshara, W., Daily, K., Egea, S. C., Pegram, M. D., Gomez-Fernandez, C., Dhir, R., Bhargava, R., Brufsky, A., Shriver, C. D., Hooke, J. A., Campbell, J. L., Mural, R. J., Hu, H., Somiari, S., Larson, C., Deyarmin, B., Kvecher, L., Kovatich, A. J., Ellis, M. J., Stricker, T., White, K., Olopade, O., Luo, C., Chen, Y., Bose, R., Chang, L. W., Beck, A. H., Pihl, T., Jensen, M., Sfeir, R., Kahn, A., Chu, A., Kothiyal, P., Wang, Z., Snyder, E., Pontius, J., Ayala, B., Backus, M., Walton, J., Baboud, J., Berton, D., Nicholls, M., Srinivasan, D., Raman, R., Girshik, S., Kigonya, P., Alonso, S., Sanbhadti, R., Barletta, S., Pot, D., Sheth, M., Demchok, J. A., Shaw, K. R. M., Yang, L., Eley, G., Ferguson, M. L., Tarnuzzer, R. W., Zhang, J., Dillon, L. A. L., Buetow, K., Fielding, P., Ozenberger, B. A., Guyer, M. S., Sofia, H. J. & Palchik, J. D., Oct 4 2012, In: Nature. 490, 7418, p. 61-70 10 p.

    Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

    Open Access
    9501 Scopus citations