TY - JOUR
T1 - Genome-wide association study of copy number variations in Parkinson’s disease
AU - the Global Parkinson Genetics Program (GP2)
AU - Comprehensive Unbiased Risk Factor Assessment for Genetics and Environment in Parkinson’s Disease (COURAGE-PD) consortium
AU - Landoulsi, Zied
AU - Sreelatha, Ashwin Ashok Kumar
AU - Kuznetsov, Nicole
AU - Schulte, Claudia
AU - Bobbili, Dheeraj Reddy
AU - Montanucci, Ludovica
AU - Leu, Costin
AU - Niestroj, Lisa Marie
AU - Hassanin, Emadeldin
AU - Domenighetti, Cloé
AU - Sugier, Pierre Emmanuel
AU - Radivojkov-Blagojevic, Milena
AU - Lichtner, Peter
AU - Portugal, Berta
AU - Edsall, Connor
AU - Krüger, Jens
AU - Hernandez, Dena G.
AU - Blauwendraat, Cornelis
AU - Mellick, George D.
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AU - Pirker, Walter
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AU - Taba, Pille
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AU - Brice, Alexis
AU - Corvol, Jean Christophe
AU - Chartier-Harlin, Marie Christine
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AU - Hadjigeorgiou, Georges M.
AU - Dardiotis, Efthimos
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AU - Brighina, Laura
AU - Ferrarese, Carlo
AU - Annesi, Grazia
AU - Quattrone, Andrea
AU - Gagliardi, Monica
AU - Burbulla, Lena F.
AU - Matsuo, Hirotaka
AU - Nakayama, Akiyoshi
AU - Hattori, Nobutaka
AU - Nishioka, Kenya
AU - Chung, Sun Ju
AU - Kim, Yun Joong
AU - Pavelka, Lukas
AU - Kolber, Pierre
AU - van de Warrenburg, Bart P.C.
AU - Bloem, Bastiaan R.
AU - Singleton, Andrew B.
AU - Vitale, Dan
AU - Toft, Mathias
AU - Pihlstrom, Lasse
AU - Guedes, Leonor Correia
AU - Ferreira, Joaquim J.
AU - Bardien, Soraya
AU - Carr, Jonathan
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AU - Ezquerra, Mario
AU - Pastor, Pau
AU - Wirdefeldt, Karin
AU - Pedersen, Nancy L.
AU - Ran, Caroline
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AU - Puschmann, Andreas
AU - Clarke, Carl E.
AU - Morrison, Karen E.
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AU - Wszolek, Zbigniew K.
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AU - Disbrow, Elizabeth
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AU - Saunders-Pullman, Rachel
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AU - Bandres-Ciga, Sara
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AU - Mencacci, Niccolò Emanuele
AU - Louie, Naomi
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AU - Puckelwartz, Megan J.
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AU - Kuhl, Maggie
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AU - Shulman, Lisa
AU - Ruffrage, Lauren
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AU - Levine, Kristin S.
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AU - Markopoulou, Katerina
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AU - Sarmiento, Ignacio Juan Keller
AU - Mata, Ignacio F.
AU - Chen, Honglei
AU - Iwaki, Hirotaka
AU - Leonard, Hampton
AU - Serrano, Geidy E.
AU - Faghri, Faraz
AU - Riley, Ekemini
AU - Shiamim, Ejaz
AU - Hernandez, Dena
AU - Hall, Deborah
AU - Wegel, Claire
AU - Comart, Charisse
AU - Pantazis, Caroline B.
AU - Cruchaga, Carlos
AU - Jonas, Cabell
AU - Fiske, Brian
AU - Casey, Bradford
AU - Siddiqi, Bernadette
AU - Sobering, Andrew K.
AU - O’Grady, Alyssa
AU - Espay, Alberto
AU - Tai, Yen
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AU - Attuah, Deborah
AU - Morris, Chris
AU - Williams-Gray, Caroline
AU - Lambert, Christian
AU - Burn, David
AU - Warner, Thomas
AU - Gentleman, Steve
AU - Walker, Richard
AU - Bhatia, Kailash
AU - Parkkinen, Laura
AU - Hu, Michele
AU - Ryten, Mina
AU - Barker, Roger
AU - Lee, Hamin
AU - Escott-Price, Valentina
AU - Finch, Spencer
AU - Obese, Vida
AU - Dey, Sumit
AU - Jasaityte, Simona
AU - Love, Seth
AU - Weil, Rimona
AU - Kaiyrzhanov, Rauan
AU - Okunoye, Olaitan
AU - Williams, Nigel
AU - Wood, Nicholas
AU - Rizig, Mie
N1 - Publisher Copyright:
© The Author(s) 2026.
PY - 2026/12
Y1 - 2026/12
N2 - We investigated the role of copy number variations (CNVs) in Parkinson’s disease (PD) using genotyping data from 10,815 patients (2731 early-onset PD, EOPD) and 8901 controls from the COURAGE-PD consortium. CNVs were analyzed using a sliding window genome-wide association and burden approach. No genome-wide significant CNVs were detected in the overall cohort, but a robust deletion spanning exons 2–6 of PRKN was identified in EOPD cases, validated by MLPA, and replicated in the GP2 dataset (23,089 cases, 18,824 controls). CNV burden was significantly enriched in PD-related genes, primarily driven by PRKN, with the strongest effect observed in EOPD. PRKN CNV carriers showed earlier age at onset, confirmed by survival analysis. No association was observed for genome-wide or large CNV burden. Our findings reinforce the pivotal role of PRKN deletions in early-onset PD and highlight the need for high-resolution CNV analysis in large cohorts to uncover additional rare contributors to PD risk.
AB - We investigated the role of copy number variations (CNVs) in Parkinson’s disease (PD) using genotyping data from 10,815 patients (2731 early-onset PD, EOPD) and 8901 controls from the COURAGE-PD consortium. CNVs were analyzed using a sliding window genome-wide association and burden approach. No genome-wide significant CNVs were detected in the overall cohort, but a robust deletion spanning exons 2–6 of PRKN was identified in EOPD cases, validated by MLPA, and replicated in the GP2 dataset (23,089 cases, 18,824 controls). CNV burden was significantly enriched in PD-related genes, primarily driven by PRKN, with the strongest effect observed in EOPD. PRKN CNV carriers showed earlier age at onset, confirmed by survival analysis. No association was observed for genome-wide or large CNV burden. Our findings reinforce the pivotal role of PRKN deletions in early-onset PD and highlight the need for high-resolution CNV analysis in large cohorts to uncover additional rare contributors to PD risk.
UR - https://www.scopus.com/pages/publications/105043709422
U2 - 10.1038/s41531-025-01245-z
DO - 10.1038/s41531-025-01245-z
M3 - Article
C2 - 42009659
AN - SCOPUS:105043709422
SN - 2373-8057
VL - 12
JO - npj Parkinson's Disease
JF - npj Parkinson's Disease
IS - 1
M1 - 160
ER -